参考答案:
原理及其主要步骤:
①质粒DNA与染色体线性DNA在拓扑学上的差异:质粒DNA(cccDNA)是共价闭合双链超盘旋构型的小分子DNA,而细胞染色体DNA在细胞裂解分离过程中断裂成线性DNA(LDNA),虽然在化学本质上没有本质区别,但在高级结构拓扑学上存在差异。
②差异碱变性:在pH12.0-12.5高pH条件下,线性的DNA容易变性解链,而质粒DNA不易变性或很少变性。
③酸复性:在pH4.8条件下,cccDNA很快复性,而线性的染色体DNA不可逆的变性并与蛋白质、RNA形成沉淀物,通过离心可以把LDNA与cccDNA分开。cccDNA在上清液中。
④酒精沉淀cccDNA:以2.5倍的95%酒精沉淀质粒DNA,(浓度为66%沉淀最好)。保存在TE(pH8.0)缓冲液中,放置在-20℃下保存备用。
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