转基因(Transgne)是指通过转基因技术导入受体细胞内的外源基因。利用转基因进行作物改良开辟了作物育种的新途径，其重要意义在于最大限度地绕过了物种生殖隔离的障碍，实现了生物界遗传物质的自由交流，能使农作物获取整个生物界的遗传资源，有可能取得突破性的育种进展。经过从上个世纪80年代初至今的20年中，产生的转基因植物已涉及50多个物种，特别是转基因棉花、水稻、玉米、大豆、烟草、多种蔬菜等已经在生产上发挥了重大的增产作用，充分显示转基因具有广阔的应用前景。
但是，转基因应用的实践表明，将外源基因导入受体仅仅为转基因利用提供了可能性，其在受体中的命运受到一系列生理生化过程的作用，并以复杂的遗传方式表现出来。如不能研究清楚，并采取相应的措施，其中也可能潜伏着巨大的危机(Jocelyn，1996)。因此，研究转基因在转化体后代中的遗传规律及其稳定性也是转基因育种研究的重要组成部分。目前已经比较清楚，影响转基因技术应用前景的主要有两大遗传问题：一是转基因的整合特性及其在世代间的传递规律；二是转基因沉默及其原因。
转基因的遗传与表达研究对于揭开生物基因与性状间的关系，从而精确地调控基因的表达也具有潜在的意义。植物转基因育种同常规育种均以目的基因的遗传与选择为依据，但常规育种所涉及的基因在分子水平上是未得到鉴别的。某个优良性状的丢失到底是目标基因突变和缺失造成的，或者仅仅是基因失活而已，很难得到确认。因此，经典育种方法所认识的基因是无法直接跟踪和研究的。因为，转基因育种所要研究的性状和基因都是预先设计好的，可以从基因的分子组成、代谢途径和性状表达三个层次跟踪研究目的基因。通过研究积累起来的知识就可以找到从分子水平上改变生物代谢途径和创造新性状的途径。
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